Trước đó, chiều tối ngày 23 đến sáng ngày 25/6 trên địa bàn tỉnh Sơn La đã xảy ra mưa to và rất to. Mưa lớn kèm theo sạt lở đất đá khu vực đồi vai trái phía trên Nhà điều độ Nhà máy Thủy điện Sơn La gây lấp cống thoát nước. Nước tràn qua đường và chảy từ Nhà điều độ xuống hành lang cao độ 180 mét vai trái và tràn xuống sân nhà máy (cao trình 138 mét) gây ngập cục bộ gian sửa chữa máy biến thế và có nguy cơ tràn vào Nhà máy.
Ngay sau khi phát hiện có nguy cơ nước tràn vào Nhà máy, lãnh đạo Công ty Thủy điện Sơn La đã báo cáo Ban chỉ huy phòng chống thiên tai và tìm kiếm cứu bạn (BCH PCTT&TKCN) Trung ương, EVN, đồng thời chỉ đạo và huy động đội xung kích chèn bổ sung ngay các bao cát trước cửa cuốn vào Nhà máy, kích cao một số thiết bị trong gian sửa chữa máy biến thế, huy động xe xúc bánh lốp của Công ty và huy động thêm một số phương tiện của đơn vị thi công mở các nắp cống, khơi thông dòng chảy.
Đến 08h00 ngày 24/6/2015, nguy cơ nước tràn vào nhà máy đã được kiểm soát, Công ty Thuỷ điện Sơn La đã tổ chức san gạt bùn đất, khơi thông lại hệ thống thoát nước và vệ sinh các thiết bị đảm bảo Nhà máy vận hành bình thường. Đến cuối ngày 28/6, Công ty Thủy điện Sơn La và các đơn vị thi công đã san gạt và vệ sinh hoàn toàn lượng bùn đất tràn xuống sân của Nhà máy.
Trước nỗ lực trên của Công ty Thủy điện Sơn La, Tập đoàn Điện lực Việt Nam đánh giá cao Công ty đã chủ động kịp thời xử lý hậu quả do cơn bão số 1 gây ra lũ quét tại khu vực Nhà máy.
Để nhanh chóng xử lý sự cố do lũ quét gây ra tại khu vực vai trái công trình nhằm đảm bảo công trình vận hành an toàn trong mùa mưa bão 2015 và ổn định lâu dài của công trình, Tập đoàn Điện lực Việt Nam giao Giám đốc Công ty Thủy điện Sơn La chỉ định thầu đối với đơn vị tư vấn thực hiện khảo sát lập thiết kế bản vẽ thi công, dự toán các hạng mục xử lý cấp bách trước ngày 30/7/2015; khảo sát, thiết kế, dự toán các hạng mục đảm bảo an toàn vận hành lâu dài công trình hoàn thành trước ngày 15/9/2015, đồng thời tổ chức thẩm tra, phê duyệt các hạng mục trên.
Đối với công tác thi công xử lý các hạng mục cấp bách, Công ty Thủy điện Sơn La chủ động thực hiện xúc dọn đất đá, dẹp dọn mặt bằng cho sạt lở đất đá trong phạm vi công trình, bổ sung đê quai chống bùn tại các khu vực để tăng dung tích cho bể trữ, gia cố hệ thống thoát nước mặt khu vực đường nội bộ K1…
Về công tác xử lý tổng thể để đảm bảo an toàn trong quá trình vận hành công trình, hoàn thành thi công trước ngày 30/5/2016. Công ty Thủy điện Sơn La trình nhiệm vụ khảo sát, thiết kế xử lý tổng thể trước ngày 25/7/2015; hồ sơ thiết kế, dự toán xử lý tổng thể trước ngày 15/9/2915; kế hoạch lựa chọn nhà thầu thi công xây dựng trình EVN trước 30/9/2015.
Nguồn vốn thực hiện công tác này được lấy từ chi phí sản xuất điện năm 2015 - 2016 của Công ty Thủy điện Sơn La.